Прокуратурой комплекса на постоянной основе проводится мониторинг задолженности по обязательствам заказчиков в рамках государственных контрактов, финансируемых за счет бюджета города Байконур. Так, в ходе мониторинга установлено, что в нарушение требований законодательства о контрактной системе в сфере закупок, заказчиком не оплачены работы, выполненные подрядчиком по государственному контракту. В целях устранения выявленных нарушений прокурором комплекса Александром Трифоновым в адрес руководителя заказчика внесено представление, а также последнему объявлено предостережение с разъяснением возможности привлечения к установленной законом ответственности. В настоящее время представление рассмотрено и удовлетворено, во исполнение требований прокурора заказчиком погашена задолженность перед подрядчиком в размере более 20 млн. рублей.