При прокуратуре комплекса создана и на протяжении ряда лет активно действует межведомственная рабочая группа по противодействию коррупции в составе ответственных работников прокуратуры комплекса, а также руководства действующих на комплексе «Байконур» правоохранительных и контрольно-надзорных органов. Рабочая группа объединяет ресурсы и усилия заинтересованных органов г. Байконура по борьбе с коррупционными проявлениями, для чего планируются и проводятся совместные мероприятия, а также обсуждаются проблемные вопросы в сфере противодействия коррупции и вырабатываются пути их решения. 23 июня 2021 г. под председательством прокурора комплекса Александра Трифонова состоялось очередное заседание указанной рабочей группы, на котором обсуждены результаты межведомственных мероприятий в первом полугодии текущего года, в том числе разобраны вскрытые рабочей группой нарушения коррупционной направленности, способствующие им причины и условия, доведена информация о принятых мерах по их устранению и недопущению в дальнейшем. Также члены рабочей группы обсудили проект плана ее работы на второе полугодие 2021 г., после чего он был утвержден прокурором комплекса и принят к исполнению. Во втором полугодии текущего года силами рабочей группы будет реализован комплекс аналитических и проверочных мероприятий, направленных на профилактику, выявление и пресечение коррупционных правонарушений на поднадзорной территории.
